ارزیابی تنوع ژنتیکی در نمونه های دو گونه جو (l. h. vulgare و.h. spontaneum l. ) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره

نویسندگان

امین ابراهیمی

پردیس کشاورزی و منابع طبیعی د انشگاه تهران محمدرضا نقوی

پردیس کشاورزی و منابع طبیعی د انشگاه تهران منی‍ژه سبکدست

پردیس کشاورزی و منابع طبیعی د انشگاه تهران محسن مردی

پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی، کرج

چکیده

در این آزمایش تنوع ژنتیکی 73 نمونه جو ایران از دو گونه h. vulgare و h. spontaneum با استفاده از 15 جفت نشانگر ریزماهواره مورد ارزیابی قرار گرفت. الگو های نواری بصورت صفر (عدم وجود باند) و یک (وجود باند) امتیاز دهی شدند. برای رسم دندروگرام ابتدا ماتریس تشابه با روش دایس تشکیل و سپس دندروگرام با استفاده از الگوریتم upgma با نرم افزار ntsyspc 2.0 رسم شد. همچنین از این نرم افزار برای رسم پراکنش نمونه ها در دو بعد اول تجزیه به مختصات اصلی (pcoa) نیز استفاده شد. بیشترین تعداد آلل در گونه h. vulgare مربوط به جایگاه های bmac0316 و hvm40 با 8 آلل و کمترین آن مربوط به جایگاه hvm70 با دو شکل بود. بیشترین تعداد آلل در گونهh. spontaneum مربوط به جایگاه hvm40 (با 9 آلل) و کمترین آن مربوط به جایگاه های hvm70 و hvmloh1a (با 2 آلل) بود. میزان pic درگونه h. vulgare از80/0 (جایگاه bmac0040) تا 19/0 (جایگاه bmag0603) و در گونه h. spontaneum از 91/0 (جایگاه bmac0415) تا 043/0 (جایگاه hvm70) متغیر بود. تجزیه خوشه ای با استفاده از ضریب دایس و الگوریتم upgma نمونه ها را به سه گروه تقسیم کرد. گروه اول شامل نمونه هایی از هر دو گونه h. spontaneum و h. vulgare که از ایران جمع آوری شده اند و گروه های دوم و سوم نیز به ترتیب شامل نمونه هایی از گونه های h. spontaneum و h. vulgare بود. نتایج حاصل از تجزیه به مختصات اصلی با نتایج حاصل از تجزیه خوشه ای همخوانی داشت. نتایج این تحقیق نشان داد که نشانگرهای ریزماهواره برای بررسی تنوع در هر دو گونهh. spontaneum و h. vulgare مفید می باشند. جایگاه های hvmloh1a و ebmac0415 در گونه h. spontaneum و جایگاه های bmac0306 و bamc0040 در گونه h. vulgare برای بررسی تنوع در این گونه ها مناسب تشخیص داده شدند.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

ارزیابی تنوع ژنتیکی در نمونه‌های دو گونه جو (L. H. vulgare و.H. spontaneum L. ) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره

در این آزمایش تنوع ژنتیکی 73 نمونه جو ایران از دو گونه H. vulgare و H. spontaneum با استفاده از 15 جفت نشانگر ریزماهواره مورد ارزیابی قرار گرفت. الگو های نواری بصورت صفر (عدم وجود باند) و یک (وجود باند) امتیاز دهی شدند. برای رسم دندروگرام ابتدا ماتریس تشابه با روش دایس تشکیل و سپس دندروگرام با استفاده از الگوریتم UPGMA با نرم افزار NTSYSpc 2.0 رسم شد. همچنین از این نرم افزار برای رسم پراکنش ...

متن کامل

ارزیابی تنوع ژنتیکی آفتابگردان آجیلی (Helianthus annuus L.) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره

تنوع ژنتیکی بین و درون 50 توده آفتابگردان آجیلی  با استفاده از 10 نشانگر ریزماهواره مورد ارزیابی قرار گرفت. تعداد آلل در مکان‌های ژنی بین 2 تا 3 با میانگین 1/2 آلل به ازای هر مکان­ژنی بود. تعداد آلل مؤثر بین 948/1 در مکان­ژنی ORS785 و 468/1 در مکان­ژنی ORS1088 با میانگین 825/1 آلل برآورد شد. بیشترین میزان هتروزیگوسیتی مورد انتظار (484/0) در مکان­­ژنی ORS785 و کمترین آن (268/0) در مکان­ژنی ORS10...

متن کامل

ارزیابی تنوع ژنتیکی آفتابگردان آجیلی (Helianthus annuus L.) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره

تنوع ژنتیکی بین و درون 50 توده آفتابگردان آجیلی  با استفاده از 10 نشانگر ریزماهواره مورد ارزیابی قرار گرفت. تعداد آلل در مکان‌های ژنی بین 2 تا 3 با میانگین 1/2 آلل به ازای هر مکان­ژنی بود. تعداد آلل مؤثر بین 948/1 در مکان­ژنی ORS785 و 468/1 در مکان­ژنی ORS1088 با میانگین 825/1 آلل برآورد شد. بیشترین میزان هتروزیگوسیتی مورد انتظار (484/0) در مکان­­ژنی ORS785 و کمترین آن (268/0) در مکان­ژنی ORS10...

متن کامل

بررسی تنوع ژنتیکی نمونه های گندم دوروم (Triticum turgidum) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره

در این تحقیق تنوع ژنتیکی ژرم پلاسم گندم دوروم (Triticum turgidum ssp. durum) با استفاده از توالی های ساده تکراری (ریزماهواره‌ها) ارزیابی شد. یکصد و چهل ژنوتیپ متعلق به مناطق مختلف (10 کشور) با 48 جفت نشانگر ریزماهواره (با پوشش یکنواخت ژنوم) مورد بررسی قرار گرفتند و از این تعداد، 37 جفت نشانگر چند شکلی نشان دادند. در مجموع از 37 جفت نشانگر، 245 آلل چند شکل متفاوت، در دامنه ای بین 2 تا 17 آلل و ب...

متن کامل

تنوع ژنتیکی ژنوتیپ‌های جو (vulgare Hordeum) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره و تجزیه ارتباط صفات وابسته به سازگاری به خشکی

این مطالعه به‌منظور بررسی تنوع ژنتیکی و گروه ‌بندی 52 ژنوتیپ جو زراعت دیم متعلق به کشورهای مصر، ایران و چین (تهیه شده از مؤسسه تحقیقات کشاورزی دیم، مراغه) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره انجام شد. پس از استخراج DNA از برگ‌های جوان، محصولات تکثیری با استفاده از 59 جفت آغازگر ریزماهواره روی ژل الکتروفورز واسرشته‌ساز پلی‌آکریلامید 5/4% تفکیک شدند. در کل از 40 جفت آغازگر ریزماهواره دارای تکثیر م...

متن کامل

ارزیابی تنوع ژنتیکی آفتابگردان آجیلی (helianthus annuus l.) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره

تنوع ژنتیکی بین و درون 50 توده آفتابگردان آجیلی  با استفاده از 10 نشانگر ریزماهواره مورد ارزیابی قرار گرفت. تعداد آلل در مکان های ژنی بین 2 تا 3 با میانگین 1/2 آلل به ازای هر مکان­ژنی بود. تعداد آلل مؤثر بین 948/1 در مکان­ژنی ors785 و 468/1 در مکان­ژنی ors1088 با میانگین 825/1 آلل برآورد شد. بیشترین میزان هتروزیگوسیتی مورد انتظار (484/0) در مکان­­ژنی ors785 و کمترین آن (268/0) در مکان­ژنی ors10...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
علوم زراعی ایران

جلد ۱۲، شماره ۳، صفحات ۳۳۳-۳۴۸

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023